位于北角的海关总部大楼于2010年12月启用。大楼楼高32层，整体楼面总面积约达41,000平方米，是第一座为香港海关而建的总部大楼。

总部大楼容纳大部分早前分布全港不同地区的海关行政及调查科系的办公室。大樓内设立了顾客服务中心， 为市民提供快捷的一站式综合服务。总部大楼亦设有多项其他设施，例如室内练靶场、羁留中心、多用途演讲厅、展览廊和传媒接待室，有助提高海关的运作效率和能力，并迎合部门的发展需要。